課程資訊
課程名稱
蛋白質體學入門
Proteomics for Beginners 
開課學期
111-2 
授課對象
生命科學院  基因體與系統生物學學位學程  
授課教師
潘思樺 
課號
Genom7014 
課程識別碼
455 M0140 
班次
 
學分
2.0 
全/半年
半年 
必/選修
必修 
上課時間
星期二6,7(13:20~15:10) 
上課地點
基醫504 
備註
本課程中文授課,使用英文教科書。與吳欣怡、辜韋智、朱俐潔、許全智等老師合開。與林妙霞、邱繼輝合授
總人數上限:30人 
 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

待補進入後基因時代,生物醫學的各項研究開始著重在探討各類基因所具有的功能、表現及其調控;其中蛋白質又被認為是生物體內實際執行這些生理功能的主要物質。而隨著質譜技術與生物資訊學的演進,蛋白質體學(Proteomics)已成為現階段一項重要的研究技術,透過大規模的分析,不僅可以讓研究人員在極短的時間內,將分析樣本中的蛋白質身份加以鑑定;同時,藉由不同分析樣本的相互比較 (如疾病組織與正常組織或是藥物治療前後),也能讓研究人員透過這些樣本間蛋白表現的差異,進而瞭解與疾病或是不同生理調控有關的訊息傳遞與相關作用機轉。本課程將針對蛋白質體學的基本原理、實驗設計、樣本製作與結果分析做系列性的介紹,以使同學能對蛋白質體研究技術有一初步的認識與了解。 

課程目標
透過此課程循序漸進的帶領同學了解在執行蛋白質體學研究時,相關實驗設計,樣本前處裡,資了結果分析以及最終實驗結果的解讀能有系列性的了解。同時也將配合討論的方式,進一步了解並回覆同學們對於蛋白質體學研究相關的各項疑問。 
課程要求
本課程因包含研究設計與資料處哩, 是以若選修人數過多時會優先開放碩博士生選讀。 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
待補 
參考書目
待補 
評量方式
(僅供參考)
   
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/21  Class Introduction / Introduction of Mass spectrometry for proteomic studies 
第2週
2/28  和平紀念日放假 
第3週
3/07  Experimental design for Proteomics  
第4週
3/14  Sample preparation and protein identification 
第5週
3/21  Qualitative Proteomics 
第6週
3/28  Fundamentals of Quantitative Proteomics: Precursor Ion-Based Relative Quantitation 
第7週
4/04  清明節放假 
第8週
4/11  Fundamentals of Quantitative Proteomics: Isobaric Labeling-Based Relative Quantitation 
第9週
4/18  Introduction of PRM/MRM 
第10週
4/25  Introduction of target MS-DIA 
第11週
5/02  Glycoproteomics (I) 14:00-16:00 
第12週
5/09  Glycoproteomics (II) 14:00-16:00 
第13週
5/16  Introduction and principle of phosphoproteomics analysis  
第14週
5/23  Application of phosphoproteomics analysis 
第15週
5/30  Introduction of databases and web tools for proteomics analysis 
第16週
6/06  Application of proteomics in clinical research 
第17週
6/13  Laboratory visiting and discussion